De film uit 2005 Batman Begins toont hoe Scarecrow probeert het water van Gotham City te vergiftigen met een angstverwekkend toxine. Dit centrale plotpunt weerspiegelt nauw een eerder verhaal uit Batman: The Animated Series.
In de film fungeert dokter Jonathan Crane, gespeeld door Cillian Murphy, als hoofd van Arkham Asylum. Hij werkt samen met de League of Shadows om een angsttoxine te maken en vervuilt het water via het leidingsysteem van de instelling. De animatieaflevering Dreams in Darkness volgt een vergelijkbaar pad, waarbij Scarecrow van plan is zijn toxine in een ondergrondse rivier te lozen die de reservoirs van Gotham voedt.
Het geanimeerde verhaal positioneert Crane als een voormalige academicus die een grootschalig psychologisch experiment over angst uitvoert in plaats van losgeld te eisen. Batman zelf wordt aan het toxine blootgesteld, ervaart levendige hallucinaties en belandt als patiënt in Arkham.
De film plaatst Crane stevig aan het hoofd van Arkham Asylum, terwijl de aflevering hem tussen zijn cel en de buitenwereld laat schakelen. Medeschrijver David S. Goyer drong er naar verluidt op aan dat Scarecrow zijn masker in de film zou dragen, waardoor het een praktisch gasmasker werd dat hem beschermt tegen het toxine.
In de animatieaflevering blijft Scarecrow blootgesteld aan zijn eigen creatie en eindigt het verhaal weer opgesloten in zijn cel, overweldigd door hallucinaties. De film benadrukt daarentegen het thema van het confronteren van angst, wat de keuze voor Scarecrow als hoofdantagonist beïnvloedde.
De scène waarin Batman Crane verslaat in de film put inspiratie uit Scarecrows debuut in de animatieserie-aflevering Nothing to Fear. Batman keert het toxine van de schurk tegen hem, waardoor Crane de held ziet als een demonische vleermuis van menselijke afmetingen.
Dreams in Darkness onderscheidt zich door horror-elementen, waaronder Batmans hallucinaties die variëren van een weerspiegeld Joker-beeld tot zijn ouders die verdwijnen in een gigantisch pistool. De aflevering gebruikt noir-achtige vertelstem en sfeervolle animatie om de psychologische spanning in Arkham te verhogen.
Stemacteur Henry Polic II levert een opvallend subtiele prestatie als Scarecrow in de aflevering, met een zachte bariton die contrasteert met momenten van wreedheid. Hoewel Jeffrey Combs later een andere invulling aan het personage gaf, toont Polic' werk in Dreams in Darkness het potentieel van de rol voor echte dreiging.