Star Trek: Enterprise ging in 2001 van start met een premisse die beloofde de franchise terug in de tijd te verplaatsen. De serie wilde de vroegste dagen van ruimte-exploratie en de geboorte van wat later de Verenigde Federatie van Planeten zou worden, in beeld brengen. Anders dan eerdere delen die voortbouwden op gevestigde bemanningen en technologie, volgde deze serie kapitein Jonathan Archer en de bemanning van de NX-01 Enterprise terwijl zij het onbekende verkenden zonder de geavanceerde middelen die latere generaties vanzelfsprekend vonden.
Star Trek: The Next Generation had ook tijd nodig om personages en toon te verfijnen in de eerste twee seizoenen. De serie won vaart in seizoen drie en vier en culmineerde in sterke verhalen zoals de tweedelige aflevering Best of Both Worlds. Enterprise hoopte een eigen koers te varen door zich te richten op de pre-Federatiegeschiedenis, een idee dat eerder aan bod kwam in de film Star Trek: First Contact. Op papier had het concept sterke aantrekkingskracht voor fans die de wortels van Starfleet wilden zien.
Vanaf de première werkte Star Trek: Enterprise aan differentiatie die uiteindelijk verdeeldheid zaaide. De eerste seizoenen lieten de naam Star Trek uit de titel weg, waardoor casual kijkers onduidelijk was wat de connectie was. Het openingsnummer Faith of the Heart neigde meer naar inspirerende dramaserie dan naar sciencefiction. Producenten zochten ook een rauwere en sensuelere toon, vooral in de uitbeelding van de Vulcan T'Pol, gespeeld door Jolene Blalock, wat botste met de gevestigde Vulcan-karakterisering.
Bredere druk verergerde de problemen. De film Star Trek: Nemesis uit 2002 leverde een teleurstellend slot van de Next Generation-filmreeks. Tegen die tijd keken kijkers al veertien jaar onafgebroken naar Star Trek-programma's. Ondanks een nieuwe showrunner en pogingen met seizoenslange verhaallijnen daalden de kijkcijfers gestaag. De serie eindigde in 2005, waarbij de finale These Are the Voyages de aandacht verlegde naar een holografische reconstructie met William Riker in plaats van het eigen verhaal van de Enterprise-bemanning af te ronden.
De serie introduceerde ondanks de ontvangst blijvende elementen. Jonathan Archer, vertolkt door Scott Bakula, bracht een nuchtere leiderschapsstijl en persoonlijke accenten zoals zijn beagle Porthos. T'Pol groeide uit van een aanvankelijk geobjectiveerde rol tot een volledig uitgewerkt personage dat ervoor koos bij de bemanning te blijven. Latere producties verwezen expliciet naar de serie, waaronder een onthulling in de finale van Star Trek: Discovery die dr. Kovich verbond met de Temporal Cold War en visuele verwijzingen plus Xindi-vermeldingen in Star Trek Beyond.
De ervaring toonde hoe veelbelovende premisses kunnen struikelen zonder zorgvuldige afstemming met publieksverwachtingen en franchise-toon. Terwijl Star Trek zich voorbereidt op een nieuwe periode zonder nieuwe series na het einde van Star Trek: Strange New Worlds en Star Trek: Starfleet Academy, blijft het verhaal van Enterprise een herinnering aan de balans die nodig is tussen vernieuwing en continuïteit.