Spelers die Beast of Reincarnation verkennen, ontdekken al snel dat wapenupgrades een kernonderdeel van de progressie vormen. Het systeem begint eenvoudig maar legt al snel limieten op die verdere verbeteringen blokkeren, zelfs als spelers over de vereiste Amber-valuta beschikken.
Verbeteringen vinden plaats aan de speciale werkbank in de Cleanse Walker-hub of via de kampmenu's. Op deze locaties kan Emma Amber uitgeven om de schade van zowel melee- als ranged-wapens te verhogen en tegelijk de munitiecapaciteit en vergelijkbare attributen uit te breiden.
De werkbank staat direct achter Brad bij de pilootstoel en grenst aan de keukenruimte waar spelers maaltijden bereiden.
Na een of twee upgrades bereiken de meeste wapens een harde limiet. Verdere vooruitgang vereist dat de interne programmering van de Cleanse Walker, bekend als Bauera, wordt verhoogd tot de drempel die op elk wapen wordt weergegeven.
Bauera houdt drie afzonderlijke attributen bij: Power (blauw), Calculations (geel) en Knowledge (groen). Power vormt meestal de belangrijkste barrière voor extra upgrades.
Reizigers verbeteren deze stats door specifieke buit te verzamelen die over de wereld verspreid ligt, meestal overblijfselen van verslagen golems. Sterke kisten en gemarkeerde waardevolle voorwerpen die door metgezel Koo zijn geplaatst, vormen betrouwbare bronnen, dus spelers doen er goed aan alert te blijven op de signalen van de hond tijdens het verkennen.
Een gestage groei van wapens blijft essentieel om de kracht van de verschillende Malefects die tijdens het avontuur worden tegengekomen bij te houden.