De sterkste vaardigheden in Beast of Reincarnation hangen af van je voorkeursaanpak, maar bepaalde keuzes springen eruit als betrouwbaar voor zowel Emma als Koo in de beginuren.
Koo fungeert als een gecontroleerde metgezel en vertrouwt daarom meer op ontgrendelde vaardigheden dan Emma. Spelers met beperkte vaardigheidspunten in het begin profiteren het meest door eerst in Koo te investeren voordat ze Emma's opties uitbreiden. Emma blijft effectief met basis parry- en dodge-manoeuvres in de eerste gevechten, waardoor ze minder afhankelijk is van de vaardigheidsboom aan het begin.
Desondanks levert een evenwichtige investering in beide personages betere resultaten op de lange termijn op. Emma volledig verwaarlozen kan de flexibiliteit beperken zodra ontmoetingen complexer worden.
Het verslaan van Nushi-bazen en het vooruitgaan in het verhaal opent extra takken op de vaardigheidsbomen. Een opmerkelijk voorbeeld is het paar vaardigheden dat wordt verkregen na de Beast of Reincarnation Rangifer-ontmoeting. Hiervan springt de Javelin-kracht eruit vanwege zijn sterke nut in latere gevechten.
Spelers moeten de nieuw beschikbare opties zorgvuldig bekijken voordat ze punten uitgeven, omdat sommige onevenredig grote voordelen bieden in combinatie met eerdere keuzes.
Naast de vaardigheidsbomen bieden wapenupgrades en recepten koken aparte routes naar grotere kracht. Deze systemen werken samen met vaardigheidsselectie om spelers voor te bereiden op zwaardere uitdagingen.