Toen Star Trek: Deep Space Nine in première ging, kreeg de serie kritiek omdat die afweek van het gebruikelijke patroon van avonturen aan boord van een sterrenschip. De show draaide om een vast ruimtestation nabij de planeet Bajor en een wormhole naar het Gamma-kwadrant, in plaats van een schip dat de sterren verkende.
Ondanks het vaste decor leverde de serie dynamischere gevechtssequenties dan zijn voorgangers. De pilotaflevering "Emissary" toont direct de Slag om Wolf 359, waarbij een Borg-kubus een Federatievloot van veertig schepen vernietigt. Eerdere series lieten alleen de nasleep zien, maar deze aflevering plaatst de kijker midden in de chaos, waarbij hoofdpersoon Ben Sisko aan boord van de USS Saratoga dient tijdens de aanval.
Ben Sisko is meer bereid om regels te buigen voor grotere doelen dan kapiteins als Jean-Luc Picard of James T. Kirk. Het verhaal toont herhaaldelijk zijn bereidheid om resultaten boven strikte principes te stellen in crisissituaties. Deze eigenschap blijkt essentieel wanneer het verhaal uitmondt in een oorlog van meerdere seizoenen tegen de Dominion, de dominante macht in het Gamma-kwadrant.
Star Trek: Deep Space Nine was de eerste serie die een langdurige oorlog over meerdere seizoenen verbeeldde, met talrijke grootschalige confrontaties die de actie boven de geïsoleerde schermutselingen uit eerdere series verhieven.
In seizoen 3, "The Die Is Cast", richt een gezamenlijke operatie van de Cardassiaanse Obsidian Order en de Romulaanse Tal Shiar zich met gecamoufleerde schepen op de thuiswereld van de Dominion Founders. De aanval mislukt wanneer de Founders, meesters in misleiding, een val opzetten die de geallieerde vloot door een veel sterkere Dominion-strijdmacht laat vernietigen.
Deze sequentie benadrukt de dreiging van de Dominion ruim voordat de volledige oorlog begint en toont hoe zelfs formidabele Romulaanse oorlogsschepen ten prooi vallen aan superieure aantallen en infiltratietactieken.
Seizoen 4, "The Way of the Warrior", brengt grote verschuivingen als een Klingon-vloot bij het station arriveert te midden van vrees voor Dominion-spionnen. De breuk in de alliantie tussen de Federatie en de Klingons leidt tot directe aanvallen op Deep Space Nine door de troepen van kanselier Gowron, waaronder Vor'cha-klasse slagkruisers en kleinere vogels van prooi.
De verdediging van het station houdt stand tegen de zwerm en de aflevering combineert vlootgevechten met enteracties. Gowrons uitspraak "Vandaag is een goede dag om te sterven" vat de Klingon-vasthoudendheid tijdens het gevecht samen.
De seizoensfinale van seizoen 5, "Call to Arms", markeert het officiële begin van de openlijke vijandelijkheden. Dominion- en Cardassiaanse troepen mikken op controle over de wormhole, wat een wanhopige verdediging door het station, de Defiant en een Klingon vogel van prooi uitlokt om tijd te winnen voor het plaatsen van een mijnenveld.
Golf na golf aanvallers test de bewapening van het station tot de mijnen liggen. De Defiant en zijn bondgenoot camoufleren zich daarna en glippen weg, waarmee een grotere confrontatie wordt voorbereid terwijl de hoofdcast zich splitst tussen bezet gebied en het front.
Seizoen 6, "Sacrifice of Angels", vormt het hoogtepunt van een langere verhaallijn, waarbij de Federatie een grootschalige poging doet om het station te heroveren. Federatieschepen staan tegenover een twee-tegen-één-overmacht van Dominion-schepen terwijl ze racen om de instorting van het mijnenveld te voorkomen.
Het gevecht beslaat bijna de hele aflevering en toont tientallen sterrenschepen in gecoördineerde manoeuvres en dramatische vernietigingssequenties. Laat arriverende Klingon-versterkingen creëren een opening, maar het beslissende moment komt wanneer Sisko de Profeten aanroept om de binnenkomende Dominion-versterkingen te verwijderen.
De seizoensfinale van seizoen 6, "Tears of the Prophets", zet de alliantie in de aanval met een aanval op het Chin'toka-systeem. Klingon-troepen gaan in brute ramacties de strijd aan met Dominion Jem'Hadar-jagers, terwijl Federatie- en Romulaanse schepen het opnemen tegen geautomatiseerde wapenplatforms die hun gelederen uiteenrijten.
Een gedurfde run van de Defiant tegen de energiebron van de platforms geldt als een van de meest spannende sequenties van de serie. Beelden uit dit gevecht keren later terug in de serie-finale en benadrukken de blijvende impact op de oorlogsweergave.
In deze afleveringen verzamelde Star Trek: Deep Space Nine een schat aan grootschalige gevechten die de serie onderscheidden van de meer episodische gevechten uit eerdere delen van de franchise.