De run van Stargate Atlantis van 2004 tot 2009 hield een speelse link met The Simpsons in stand die jaren eerder begon op Stargate SG-1. In de seizoenspremière van seizoen 5 maakt Lt. Colonel John Sheppard van een simpele bier-vraag een test die echte bondgenoten scheidt van vermomde bedreigingen.
Geïsoleerd nadat een val een lab heeft doen instorten, hoort Sheppard reddingswerkers naderen. Hij wordt wantrouwig wanneer hem wordt verteld dat gevechtsingenieur Harris erbij is, wetende dat Harris eigenlijk met verlof is. Om zijn twijfels over de groep als Human-Wraith-hybriden te bevestigen, biedt Sheppard gratis drankjes aan en vraagt of ze Duff Beer of Oprah Ale prefereren.
De redders kiezen voor Duff, waarna Sheppard zijn teamgenoot Ronon Dex waarschuwt dat de groep niets van The Simpsons afweet en geen bier drinkt. Het tweetal bereidt zich voor op een gevecht, waarmee de fictieve lager de bedriegers ontmaskerde.
Stargate SG-1 liep tien seizoenen en toonde Colonel Jack O'Neill als uitgesproken fan van de animatieserie. De connectie werkte twee kanten op, met een Simpsons-aflevering vol Stargate-knipoogjes en een optreden van Richard Dean Anderson zelf.
Dan Castellaneta, de stem van Homer Simpson, speelde ook een gastrol in SG-1 in de aflevering Citizen Joe uit seizoen 8. Toen Atlantis als spin-off van start ging, zette het diezelfde luchtige band voort, al kwam het Duff Beer-moment pas in het laatste seizoen.
Het Sci-Fi-kanaal stopte Atlantis na vijf seizoenen in 2009, waardoor de Duff Beer-uitwisseling de enige Simpsons-knipoog werd. De korte scène eerde toch de eerdere traditie en had O'Neill een knikje waardig gemaakt.
Duff Beer is the cause of and solution to all of life's problems.